Se você tem certeza que o firewall está liberando as portas de email (143, 25, 110) e que seu serviço está operando normalmente no whm cpanel a saída está aqui:
/scripts/autorepair net_smtp_fix
Abraços e caso funcione eu quero 1 caixa de Bis!
Nada de pânico, se você já foi em tweak settings e tentou ativar o danado do webmail e mesmo assim ele não funfou, nada de pânico, entre no console, caso use apf rode iptables -F, caso rodo csf rode csf -f.
Tente acessar 
Isso normalmente é firewall barrando a porta de webmail 2095
fonte: http://littleoak.wordpress.com/2009/07/31/webmail-nao-acessa-nem-por-reza-brava-problema-com-acesso-a-webmail-no-whm-cpanel/
